สำนักงานสาธารณสุขอำเภอ เป็นราชการบริหารส่วนภูมิภาคของกระทรวงสาธารณสุข มีอำนาจหน้าที่ ดังนี้
        1. ดำเนินการและประสานงานเกี่ยวกับงานสาธารณสุขในเขตพื้นที่อำเภอ
        2. กำกับ ดูแล และสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานที่รับผิดชอบในเขตพื้นที่อำเภอ
        3. ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมาย
        
• ภารกิจรอง
    1.พัฒนาวิชาการแก่บุคลากรสาธารณสุข  องค์กรสุขภาพภาคประชาชน
    2.สนับสนุนและควบคุมการปฏิบัติงานของหน่วยงานสาธารณสุขในสังกัด
 
• ภารกิจสนับสนุน
     บริหารจัดการทรัพยากรสาธารณสุขของหน่วยงานในสังกัด
 
• ภารกิจหลัก
                   1.ประสานนโยบายและจัดทำแผนยุทธศาสตร์ด้านสุขภาพร่วมกับหน่วยงานภาครัฐ ภาคท้องถิ่น
                   องค์กรธุรกิจเอกชน และภาคประชาสังคมในพื้นที่ระดับอำเภอ/ตำบล
                   2.ประเมินผลการดำเนินงานเครือข่ายบริการสุขภาพ
                   3.ควบคุมมาตรฐานการปฏิบัติงานของหน่วยงานสาธารณสุขในสังกัด
                   4.คุ้มครองผู้บริโภคด้านบริการและผลิตภัณฑ์สุขภาพในพื้นที่
                   5.ดำเนินงานตามกฎหมายการแพทย์และกฎหมายสาธารณสุข
                   6.ปฏิบัติงานตามนโยบายเร่งด่วนด้านสุขภาพของรัฐบาล กระทรวง จังหวัด